新疆应用数学自治区重点实验室于2014年获批建设。实验室以建设成为国内一流、国际上有重要影响力的数学学科为目标，以“人才培养、学科建设、科学研究、技术突破”为根本任务，着眼于国家和新疆社会经济发展的需要，为全国特别是新疆地区培养一批理论基础扎实、学术能力强的创新型人才。

实验室现有研究人员62人，其中教育部国家人才教授1人，新世纪百千万人才工程国家级人选1人，教育部新世纪优秀人才1人，自治区杰青8人，自治区“天山英才”领军人才1人，自治区“天山英才”青年拔尖人才8人，并建成了1个教育部创新团队和4个自治区创新团队。实验室现有3个研究方向：

（1）图论及其应用

图论及其应用是重点实验室的传统优势、特色研究方向，产出了一大批丰硕的研究成果，在国际上都有一定的影响，被国际同行誉为“乌鲁木齐学派”。本方向培养了一大批图论方向的研究、应用型人才，在各行各业中成为骨干力量，形成了一支各民族团结、和谐、富有创新精神和团队意识、具有较高协同科研攻关能力的研究团队。2013年“组合优化与图论”入选教育部创新团队。该方向围绕国际相关研究热点，综合应用图论、组合优化、代数学、概率方法等多种数学工具，开展三方面的研究：图与近似算法、图与网络优化、图谱理论及其相关应用。

（2）微分方程理论及其应用

微分方程理论是应用数学的重要组成部分，它包括常微分方程、偏微分方程、泛函微分方程，以及微分方程数值解等许多重要研究分支。在自然科学、经济学、社会科学的许多领域有着广泛的应用，并且产生了许多新兴交叉学科领域，如：动力系统、控制系统、生物动力系统、传染病动力学、人工神经网络、动态经济学等。所有这些交叉学科的发展已成为应用数学的重要组成部分。该方向主要研究生物动力系统理论、复杂网络理论、传染病数学模型理论。

（3）科学计算与优化应用

当今计算机的发展已将计算方法的研究推向科学研究的前沿。科学计算已经成为第三种科研方法。科学计算与理论分析、科学实验共同成为当代科学研究的三大支柱，并以前所未有之势推动科学技术革命。科学与工程计算是应用数学的重要组成部分，它包括偏微分方程数值解、不确定性量化计算、图像处理与反问题、最优化方法及其应用等许多重要研究分支。该方向主要研究偏微分方程数值解、科学计算与不确定性量化、最优化方法及其应用。

近五年来，实验室在环境建设、科研项目、科研成果、人才培养等方面取得了长足的进步，实验室共承担各类科研课题150余项，其中国家自然科学基金重点项目2项，国家自然科学基金项目55项，其他各类项目100余项，立项经费约3200万元。在国内外重要学术期刊上发表论文900余篇，其中SCI收录700篇。培养博士研究生37人，硕士研究生387人，获自治区科技进步奖一等奖1项，二等奖1项；获自治区自然科学一等奖3项，二等奖1项；获自治区优秀论文奖10项。