姓名： 夏俊峰 |
 |
教授 博士生导师 |
邮箱：junfeng.xia@foxmail.com |
研究领域：机器学习与生物信息学 |
教育经历
2005.09-2010.06 中国科学技术大学，生物信息学专业，博士学位
2001.01-2005.06 安徽大学，生物技术专业，学士学位
工作经历
(1)2010至2013 美国范德堡大学生物医学信息系，博士后
(2)2013.04至今 任教于安徽大学
主持或参加的科研项目
（1）国家自然科学基金联合基金重点项目: 面向基因突变功能效应预测的人工智能算法研究，项目批准号: U22A203，2023/01- 2026/12，主持
（2）国家自然科学基金重点项目: 新型蛋白元件智能设计与优化方法研究，项目批准号: 62532017，2026/01- 2030/12，参与 (合作单位课题主持人)
（3）国家自然科学基金重点项目: 载能粒子对关键生物靶的分子调控机制与应用基础研究，项目批准号:11835014，2019/01- 2023/12，参与 (合作单位课题主持人)
（4）国家自然科学基金面上项目: 致病同义突变的生物信息学研究，项目批准号: 62072003，2021/01 – 2024/12，主持
（5）国家自然科学基金面上项目:癌症驱动突变的生物信息学分析和实验验证，项目批准号:61672037，2017/01 – 2020/12，主持
科研成果（论文、专著等）
[1] Wenying Li, Haiyun Wang, Jianping Zhao, Junfeng Xia, Xiaoqiang Sun, scHyper: reconstructing cell-cell communication through hypergraph neural networks, Briefings in Bioinformatics, 2024, 25(5): bbae436（一区）
[2] Zile Wang, Haiyun Wang, Jianping Zhao, Junfeng Xia, Chunhou Zheng, scVSC: Deep Variational Subspace Clustering for Single-Cell Transcriptome Data, IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2024, 21(5):1492-1503（三区）
[3] Jiwei Fang, Henghui Fan, Jintao Zhao, Jianping Zhao, Junfeng Xia, AMCL: supervised contrastive learning with hard sample mining for multi-functional therapeutic peptide prediction, BMC Biology, 2025, 23(1):170（二区）
[4] Yishan Yue, Henghui Fan, Jianping Zhao, Junfeng Xia, Protein language model-based prediction for plant miRNA encoded peptides, PeerJ Computer Science, 2025, 11:e2733（三区）
[5] Jinling Cai, Jianping Zhao, Yannan Bin, Junfeng Xia, Chunhou Zheng, iAmyP: A Multi-view Learning for Amyloidogenic Hexapeptides Identification Based on Sequence Least Squares Programming, Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2025, 17(2):277-292（二区）
[6] Sitong Niu, Henghui Fan, Fei Wang, Xiaomei Yang, Junfeng Xia, Identification of Multi functional Therapeutic Peptides Based on Prototypical Supervised Contrastive Learning, Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2025, 17(2): 332-343（二区）
[7] Zile Wang, Fengyu Lei, Xiaoping Shi, Jianping Zhao, Junfeng Xia, scDMSC: Deep Multi-View Subspace Clustering for Single-Cell Multi-Omics Data, IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2025, 29(6):4534-4545（一区）
[8] Chenchen Jia, Haiyun Wang, Jianping Zhao, Junfeng Xia, Chunhou Zheng, scSDNE: A semi supervised method for inferring cell-cell interactions based on graph embedding, PLoS Computational Biology, 2025, 21(5): e1013027.（二区）
[9] Ting Li, Henghui Fan, Jianping Zhao, Xiaomei Yang, Junfeng Xia, MultiPep-DLCL: recognition of multifunctional therapeutic peptides through deep learning with label-sequence contrastive learning, Briefings in Bioinformatics, 2025,26(3):bbaf274 （一区）
[10] Xiaomei Yang, Meng Liao, Bin Ye, Junfeng Xia, Jianping Zhao, iEnhancer-GDM: A Deep Learning Framework Based on Generative Adversarial Network and Multi-head Attention Mechanism to Identify Enhancers and Their Strength, Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2025, 17(3): 662-672 （二区）
[11] Jintao Zhao, Henghui Fan, Jiwei Fang, Jianping Zhao, and Junfeng Xia, MCMFPP: A Multifunctional Peptides Prediction Method Based on Class Feature Enhancement and Classifier Fusion, Journal of Chemical Information and Modeling, 2025, 65(19): 10124-10140 （二区）
[12] Bing Zhang, Jianping Zhao, Yannan Bin, Junfeng Xia, iALP: Identification of Allergenic Proteins Based on Large Language Model and Gate Linear Unit, Interdisciplinary Sciences: Computational Life Sciences, 2025, 17: 860-872 （二区）
教学工作与学生培养
1.在新疆大学的主要讲授课程：
（1）《机器学习》，面向统计学和应用研究生；
（2）《人工智能(前沿)》，面向统计学和应用统计研究生。
2.在新疆大学的学生培养情况
（1）协助指导11名硕士研究生已毕业；
（2）目前协助指导在读博士2名；
（3）目前在读硕士研究生6名；
（4）团队成员晋升教授1人，副教授2人；
（5）团队成员申请到国家及自治区科研项目4项。
